Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irx5Q9JKQ4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms