Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg7Q9D906 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms