Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efhd1Q9D4J1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms