Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms