Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exo5Q9CXP9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms