Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl3Q99N95 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms