Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms