Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenomQ8VHC3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenomQ8VHC3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms