Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx19Q8R1Q0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms