Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnl3Q8CGK6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms