Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pdcl3Q8BVF2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms