Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc29Q80VM3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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