Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc57Q6PHN1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc57Q6PHN1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms