Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms