Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Odf1Q61999 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Odf1Q61999 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Odf1Q61999 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Odf1Q61999 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Odf1Q61999 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Odf1Q61999 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Odf1Q61999 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Odf1Q61999 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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