Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms