Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms