Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnga4Q3UW12 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms