Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Gtpbp6Q3U6U5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Gtpbp6Q3U6U5 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Gtpbp6Q3U6U5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Gtpbp6Q3U6U5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Gtpbp6Q3U6U5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Gtpbp6Q3U6U5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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Gtpbp6Q3U6U5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms