Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnn1Q08091 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnn1Q08091 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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