Protein–RNA interactions for Protein: Q02013

Aqp1, Aquaporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp1Q02013 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aqp1Q02013 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms