Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Irx3P81067 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms