Protein–RNA interactions for Protein: P70353

Nfyc, Nuclear transcription factor Y subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfycP70353 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfycP70353 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfycP70353 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfycP70353 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfycP70353 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms