Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pex2P55098 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pex2P55098 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms