Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FmodP50608 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FmodP50608 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
FmodP50608 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FmodP50608 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FmodP50608 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FmodP50608 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FmodP50608 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FmodP50608 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FmodP50608 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FmodP50608 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FmodP50608 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FmodP50608 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FmodP50608 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms