Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prox1P48437 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prox1P48437 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prox1P48437 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms