Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Mmp9P41245 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Mmp9P41245 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Mmp9P41245 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Mmp9P41245 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Mmp9P41245 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Mmp9P41245 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Mmp9P41245 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp9P41245 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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