Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh4P39038 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms