Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms