Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Esr1P19785 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Esr1P19785 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Esr1P19785 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Esr1P19785 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Esr1P19785 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Esr1P19785 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Esr1P19785 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Esr1P19785 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Esr1P19785 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Esr1P19785 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Esr1P19785 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Esr1P19785 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Esr1P19785 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Esr1P19785 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Esr1P19785 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Esr1P19785 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms