Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms