Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vti1bO88384 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vti1bO88384 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms