Protein–RNA interactions for Protein: O35980

Nthl1, Endonuclease III-like protein 1, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nthl1O35980 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nthl1O35980 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nthl1O35980 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nthl1O35980 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nthl1O35980 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nthl1O35980 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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