Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

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Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kif3cO35066 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif3cO35066 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms