Protein–RNA interactions for Protein: A2AGW7

Gm13089, Predicted gene 13089, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13089A2AGW7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm13089A2AGW7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm13089A2AGW7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm13089A2AGW7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm13089A2AGW7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm13089A2AGW7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm13089A2AGW7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm13089A2AGW7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms