Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SNX13Q9Y5W8 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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SNX13Q9Y5W8 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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SNX13Q9Y5W8 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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SNX13Q9Y5W8 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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SNX13Q9Y5W8 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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SNX13Q9Y5W8 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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SNX13Q9Y5W8 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNX13Q9Y5W8 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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