Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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BRPF3Q9ULD4 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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BRPF3Q9ULD4 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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BRPF3Q9ULD4 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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BRPF3Q9ULD4 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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BRPF3Q9ULD4 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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BRPF3Q9ULD4 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRPF3Q9ULD4 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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