Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147 ms