Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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