Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SKIDA1Q1XH10 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SKIDA1Q1XH10 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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