Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
IMPG1Q17R60 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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