Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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