Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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SGCBQ16585 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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SGCBQ16585 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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SGCBQ16585 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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SGCBQ16585 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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SGCBQ16585 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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