Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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RPE65Q16518 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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RPE65Q16518 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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RPE65Q16518 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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RPE65Q16518 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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RPE65Q16518 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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RPE65Q16518 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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RPE65Q16518 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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RPE65Q16518 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RPE65Q16518 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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