Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ZFHX3Q15911 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
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