Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN9AQ15858 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SCN9AQ15858 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SCN9AQ15858 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SCN9AQ15858 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SCN9AQ15858 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SCN9AQ15858 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SCN9AQ15858 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SCN9AQ15858 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SCN9AQ15858 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SCN9AQ15858 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SCN9AQ15858 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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