Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
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