Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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