Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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SHPRHQ149N8 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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SHPRHQ149N8 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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SHPRHQ149N8 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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SHPRHQ149N8 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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SHPRHQ149N8 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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SHPRHQ149N8 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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SHPRHQ149N8 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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SHPRHQ149N8 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
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SHPRHQ149N8 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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SHPRHQ149N8 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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SHPRHQ149N8 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SHPRHQ149N8 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SHPRHQ149N8 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SHPRHQ149N8 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SHPRHQ149N8 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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