Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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COL9A2Q14055 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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COL9A2Q14055 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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COL9A2Q14055 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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COL9A2Q14055 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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COL9A2Q14055 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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